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光学显微镜只能看到细胞的基本结构(细胞壁、细胞膜、细胞质、细胞核)、极少数细胞器(叶绿体、染色后的线粒体)还有染色后的染色体等。
对于细胞来说:细胞壁、细胞核、内质网、线粒体、叶绿体、高尔基体等是可以直接在光学显微镜下观察到外观形状的,属于显微结构。
显微镜是利用凸透镜的放大成像原理,将人眼不能分辨的微小物体放大到人眼能分辨的尺寸,其主要是增大近处微小物体对眼睛的张角(视角大的物体在视网膜上成像大),用角放大率M表示它们的放大本领。