1、取出植株：发现水培的芦荟根部出现腐烂的迹象，就不能继续再水培了，否则会影响到整体的生长，最终导致水培的芦荟出现问题。先将水培的芦荟从容器中取出来，将容器中的水倾倒出去。
2、切除烂根：准备好一把锋利的刀子，将芦荟底部腐烂的根部切除掉，但凡是有腐烂的地方都要切除掉，光留下健康的部分。
3、消毒杀菌：将腐烂的根部切除掉之后，开始做好消毒杀菌工作。消毒溶液可用多菌灵或甲基托布津兑水混合稀释，之后将芦荟浸泡到杀菌剂中，大约浸泡一天左右，将芦荟捞出来放在旁边阴凉的位置晾干。
4、重新水培：将水培的容器清洗干净，做好消毒杀菌处理，之后更换上新的水质，把芦荟重新放在容器中水培，伤口略微没入水面，避免再次腐烂。