要确保员工的合作和配合进行财产清查，首先需要建立一个完善的财产清查制度和流程，明确清查的标准和步骤。其次，需要加强员工的培训和教育，让他们了解清查的重要性和必要性，以及清查的具体操作方法。同时，可以采取激励措施，如奖励那些配合清查的员工，让他们愿意参与到清查工作中。另外，利用科技手段，如使用资产管理软件或者RFID技术对资产进行跟踪和管理，可以提高清查的效率和准确性。最后，建立严格的监督和审计机制，对清查结果进行核实和审计，确保清查工作的公正性和准确性。
例如，某公司在进行资产清查时，制定了详细的清查标准和流程，通过内部培训和沟通让员工了解清查的重要性，同时使用资产管理软件对资产进行实时跟踪和管理。在清查过程中，公司领导也亲自参与，对清查结果进行逐项审计核实。这样一来，员工愿意配合清查，并且清查工作也取得了较好的效果。