长期利率和短期利率在利率期限结构中的作用有很大的区别。长期利率通常指的是债券的利率，期限通常在10年以上，而短期利率通常指的是短期货币市场的利率，期限通常在一年以内。
长期利率在利率期限结构中起着引导长期投资、反映长期宏观经济预期、折现未来现金流等作用。长期利率受到长期供求关系、通货膨胀预期、国家经济政策等多方面因素的影响。管理者在决策时要考虑长期利率的变化对未来投资的影响，尤其是长期资本项目的投资，需要考虑长期利率的变动对项目的现值和内部收益率的影响。
短期利率在利率期限结构中主要影响短期融资和短期投资决策。短期利率受到货币政策、通货膨胀预期、市场供求关系等因素的影响。管理者在决策时要考虑短期利率的变化对资金成本和融资成本的影响，尤其是短期资金周转频繁的企业，短期利率的波动会直接影响企业的融资成本和盈利能力。
在实际运用中，管理者可以通过利率敏感性分析来评估不同利率变动对企业价值的影响，根据不同的利率环境来优化企业的融资结构和投资决策。同时，管理者也可以利用金融衍生品工具来进行利率风险管理，如利率互换、利率期货等工具来规避利率波动带来的风险。
因此，长期利率和短期利率在利率期限结构中的作用不同，管理者需要根据企业的具体情况和投资需求来合理运用不同期限的利率信息，从而更好地进行财务管理和决策。