超时默认制度是指员工在工作日加班超过一定时间后系统自动记录加班时间。这种制度在一定程度上可以帮助企业监控员工的工作时长，但是如果员工加班是因为工作任务的紧急程度所致，可能会导致员工加班时间被记录在内，影响员工的工作积极性和工作满意度。因此，可以考虑根据工作任务的紧急程度对超时默认制度进行调整。
一种可行的做法是在系统中设置一个优先级选项，员工在提交加班申请时可以选择工作任务的紧急程度，系统根据选择的优先级进行自动记录加班时间。比如，对于紧急任务，系统可以不计入超时默认时间；对于一般任务，系统按照默认规定记录加班时间。这样既可以保证企业对员工工作时长的监控，也可以合理考虑员工加班的原因，提高员工的工作积极性和满意度。
另外，管理者也可以定期与员工沟通，了解员工加班的原因，如果发现是因为工作任务的紧急程度导致的加班，可以适当调整工作安排，避免员工过度加班。同时，也可以鼓励员工合理安排工作时间，提高工作效率，减少加班需求。
在实际操作中，管理者可以结合具体情况，灵活调整超时默认制度，以适应不同的工作任务和员工需求，既保证企业的正常运转，又关心员工的工作生活平衡，提高员工工作满意度和生产效率。