法律分析:视情况而定。存疑不起诉不会留下案底,案底只能由人民法院依法判决,如果确实构成犯罪的,人民法院判决生效以后会有案底;存疑不起诉说明行为人并未被法院定罪,也就是无罪之人,自然没有案底的。
法律依据:《中华人民共和国刑事诉讼法》 第二百七十五条 犯罪的时候不满十八周岁,被判处五年有期徒刑以下刑罚的,应当对相关犯罪记录予以封存。犯罪记录被封存的,不得向任何单位和个人提供,但司法机关为办案需要或者有关单位根据国家规定进行查询的除外。依法进行查询的单位,应当对被封存的犯罪记录的情况予以保密。