深海鱼油是人们公认的对健康最为有利的一种产品，但人们在平时吃深海鱼油的时候，也需对其可能出现的副作用多多了解。
深海鱼油的副作用：
对于很多人来说，每天服不超过3克鱼油的情况下，都是安全的，不会出现任何深海鱼油的副作用。
服用深海鱼油剂量过高，会导致血液不易凝结，增加出血的风险。可能会出现的深海鱼油的副作用有：嗳气，口臭，胃灼热，恶心，稀便，皮疹和流鼻血。随餐服用深海鱼油补充剂，往往可以减少这些副作用的产生。
服用深海鱼油剂量过高，会导致血液不易凝结，增加出血的风险
某些鱼类，特别是鲨鱼、鲭鱼和养殖鲑鱼，可能会受到汞和其他化学品的污染。因此，选择鱼油类补充剂时，要选择纯度高，提取自深海无污染鱼类的鱼油产品，绿色海域鱼或深海小鱼保障食物链环境污染度最低，相对更加安全。
服用鱼油的禁忌注意：
专家认为，天然鱼油中含有DHA是神经系统细胞生长及维持的一种重要元素，鱼油中含有的EPA成分虽然也具有调节血脂、软化血管的作用，但是应当了解的是，鱼类本身并不能合成DHA，而是因为吃了含有DHA的藻类在体内有所积累，因而纯度并不高。
商家对鱼油的健脑、提高智力等功效多为夸大甚至虚假宣传。随着环境污染的日益加剧，鱼油内容易残留汞等重金属污染，对人体形成危害。
而另有专家指出，由于某些鱼类含有汞，而汞污染物的大量存在，会损害新生儿以及儿童正在发育的神经系统，婴幼儿应慎吃鱼油。美国已有研究证明长期足量地摄入DHA可将孩子的智商提高7%，视力提高0.2%。
由于深海鱼油富含大量DHA，成了一些家长为孩子预备的“补品”。但婴幼儿缺乏相应的酶，对深海鱼油中的汞无法“解毒”，服用后效果可能适得其反。