合作开发
癌症早期检测抗原蛋白芯片技术
商业计划书
抗原蛋白芯片癌症早期检测公司筹建办公室
二零一零年二月
合作开发早期检测癌症抗原蛋白芯片技术商业计划书
目 录
概要 …………………………………………………… 第一章:项目简介 …………………………………
一、项目意义
二、项目简要技术原理 三、项目的目标 四、项目效益预估
第二章:项目背景 …………………………………
一、癌症早期检测的意义
二、癌症检测技术的现状及其局限性 三、分子生物学癌症检测技术背景 第三章:抗原蛋白芯片癌症检测技术介绍
…… 一、抗原蛋白芯片癌症检测技术的机理 二、抗原蛋白芯片癌症检测技术的研发进展 三、本项目研究团队抗原蛋白芯片癌症检测 技术的独创性
第四章:项目开发阶段及投资需求 ………………
一、项目开发阶段
二、第一阶段肺癌抗原蛋白检测芯片产品临 床前阶段开发进度
三、完成各开发阶段的成果和意义
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第五章:市场需求预测 ……………………………
一、癌症发病率现状,治愈率现状 二、国家、人民生活水平高低、富裕程度 三、高危人群数量 四、检测消费价格 五、结论
第六章:风险评估及风险管理 ………………………
一、可能存在的风险 二、风险管理和对策
第七章: 公司管理结构和人员编制 …………………
一、开发第一阶段管理结构和人员编制 二、开发第二阶段管理结构和人员编制 三、开发第三阶段管理结构和人员编制 第八章: 项目投资预算 ……………………………
一、开发第一阶段投资预算(1680万元) 二、开发第二阶段投资预算(5590万元) 三、开发第三阶段投资预算(3亿7360万元) 附录一:研发团队成员介绍
………………………
一、翁长仁博士介绍 一、翁长仁博士简历
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合作开发早期检测癌症抗原蛋白芯片技术商业计划书
合作开发癌症早期检测 抗原蛋白芯片技术商业计划书
概要
在癌症发病机制不清楚的情况下,癌症病灶早期发现是征服癌症的主要技术路线,能够在简单抽血化验就能知道是否得早期癌症的技术可以在广泛的基层推广的癌症早期检测技术,效果好、成本低。和医学影像诊断、细胞诊断和组织学诊断是癌症诊断的三个关键技术领域;手术、放疗和化疗以及中医康复是癌症治疗的主要技术手段,这些技术一起构成了解决癌症问题的产业链。本项目从产业链的最前端开始,通过癌症抗原抗体生物芯片技术,实现癌症的早发现。
抗原蛋白芯片癌症检测技术是翁长仁集合专业优势,经近十年潜心研究的结晶,是一项可以应用于癌症早期检测的重大科研成果。拟与XXXX公司合作,在国内完成进一步的临床试验后,实现该项技术的产业化,提高国内癌症的诊断和医疗水平,以造福于人类。
在融资和发展规模方面,我们已经设计了一个完整的框架。在诸多不同种的癌症中,我们已经实现了肺癌早期检的技术,所以,选择肺癌作为第一个攻克的癌症。完成肺癌检测平台之后,再将该技术扩展至其它主要癌症。项
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目总投资4亿4630万人民币,分成三个阶段。
第一阶段:在大约2年内完成,租用外面的场地或者使用别人的场地,需要投入资金1680万元人民币。这个阶段特点是在国内重复肺癌检测的结果(85%的准确率),并将技术扩展到肝癌、胃癌、结直肠癌、乳腺癌、和食管癌这六种主要癌症,将申请获得各种癌症自主知识产权发明专利,启动临床测试和申请通过药监局市场准入。 第二阶段:在一年半内完成,自己设计和建造厂房,需要再投入资金5590万元人民币,进入小规模抗原蛋白芯片批量生产(100万片/年),基本形成区域营销服务网络。每年获得5亿元总产值,9900万元人民币的利润总额。 第三阶段:在一年半内完成,需要投入总经费3亿7360万元人民币,进入大规模抗原蛋白芯片批量生产(1000万片/年),在国内基本形成营销服务网络。每年获得30亿元总产值,89850万元人民币的利润总额。 各阶段主要信息归纳于下列概要附表。 概要附表 阶段 资金投入(万元) 第一 1680 阶段 截止成果 年限(年) 2 主要癌症自主知识产权专利 总产值(万元) 0 利润总额(万元) 0 4 页 共68页 第
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第二 5590 3 阶段 第三37360 5 阶段
小规模批量生产芯片 大规模批量生产芯片 50000 300000 9900 89850 5 页 共68页 第
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第一章:项目简介
一、项目意义
癌症晚期才被发现是癌症低治愈率的关键因素之一。除个别癌症(如宫颈癌,宫颈癌较特殊)之外,目前世界上尚无高准确率、低成本、无创伤的早期检测手段,开发一组具检测早期癌症功能的抗原蛋白生物标记物筛查高危人群是提高治愈率的有效途径之一。本项目的抗原蛋白芯片癌症早期检测技术是一项可以应用于癌症早期检测的重大实用技术成果。开发这一技术将可检出早期癌症,使全国目前每年近400万的癌症患者多数免于死亡。
二、项目简要技术原理
现有的癌症检测手段多只能检测出晚期癌症,而抗原蛋白芯片癌症早期检测技术着重检测早期癌症。现有的癌症科学研究显示,癌症的发生主要起因于不同因素引起的几个、几十个、甚至几百个相关基因的突变或失调。这些突变或失调基因的表达产物(蛋白)因在质或量上与正常状态迥异,被人体自身免疫系统识别为外源蛋白而引发免疫反应,产生抗体。抗原蛋白芯片癌症早期检测技术就是通过检测这些抗体检测癌症。因免疫反应一般在外物侵入早期最为强烈,故以检测免疫反应为检测基础的抗原蛋白芯片癌症检测技术能够有效检测早期癌症。
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三、项目的目标
开发抗原蛋白芯片癌症早期检测技术的总目标是,获得一组具检测功能的抗原蛋白生物标记物,用来准确早期检测包括肺癌、肝癌、胃癌、结直肠癌、乳腺癌、食管癌的六种主要癌症。总目标由以下几个小目标组成: a、获得一组具检测早期癌症功能的抗原蛋白生物标记物;
b、建立一套与该技术配套的完整的分子生物学实验方法;
c、开发一套与该技术配套的完整的数据统计分析流程; d、建立预测早期癌症的临床分析检测系统平台,为受检者提供癌症早期检测服务;
e、生产出包含抗原蛋白芯片及配套试剂的试剂盒产品。 完成本项目后,我们将得到世界领先水平的癌症早期检测技术,开发出可为全国(或全世界)癌症高危人群提供癌症早期检测服务的产品系统。我们将获得一组估计由二百个左右抗原蛋白组成的具早期检测六种癌症功能的抗原蛋白生物标记物,建立与该组抗原蛋白生物标记物相匹配的一套完整的分子生物学实验方法和数据统计分析流程,这些成果加上相应的仪器设备将组成一套检测早期肺癌的临床分析检测系统平台和相应的试剂盒。早期癌症检测准
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确率将达到85%以上(灵敏性85%,特异性85%),争取达到90%;将申请获得至少两项发明专利。
四、项目效益预估
如果我们率先开发出抗原蛋白芯片癌症检测平台,那么我们在这一技术上处于垄断地位,再者,该检测技术的成本不高,以蛋白芯片定价300元人民币、总检测费用定价500元人民币的价位,我们还可以得到丰厚的利润。表一列出了不同生产规模的生产效益估算。推广初期的小规模生产,我们可以制定较高的芯片销售价,即芯片价500元人民币(相应总检测价为700元人民币)(表一a)。进入大规模生产后,我们可以降低价格,即300元人民币(相应总检测价为500元人民币)(表一b),让更多的受检者加入筛查行列。
表一、芯片生产规模效益测算
a、小规模芯片生产效益测算—每片售价500元
产量 销售(万片/价格 年) (元/片) 10 500 50 500 100 500 销售 收入 (万元) 5000 25000 50000 单位 成本 (元/片) 200 200 200 生产 成本 (万元) 2000 10000 20000 利润 总额 (万元) 1940 9900 9900
b、大规模芯片生产效益测算—每片售价300元
产量 销售销售 单位 生产 利润 8 页 共68页 第
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(万片/年) 价格 收入 成本 成本 总额 (元/(万(元/(万(万片) 元) 片) 元) 元) 300 300 90000 190 57000 16890 600 300 180000 175 105000 41400 1000 300 300000 150 150000 89850
如果我们达到100万片的生产规模(小规模),按初期每片500元人民币的价格,每年获得5亿元总产值,9900万元人民币的利润总额;如果我们达到1000万片的生产规模(大规模),按每片300元人民币的价格,每年获得30亿元总产值,89850万元人民币的利润总额。
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第二章:项目背景
一、癌症早期检测的意义
1、癌症威胁现状
近30年,癌症死亡率在中国一直呈持续增长趋势。70年代、90年代和21世纪初每年死于癌症的人数分别为70万、117万和150万, 2006年接近300万,目前癌症死亡已位居各类死因的第一位。据预测,如不加以控制,中国癌症死亡人数在今后30年中将上升一倍。 2、降低癌症威胁,关键在于早期发现
对绝大多数癌症,只要在癌症的早期检出,治愈率可以大大提高。恶性程度较高的肺癌,从早期发展至晚期只需半年,当肺癌病人不适就医之时,往往已是晚期,一旦确诊,其五年存活率只有10%-15%。如果肺癌病人能在早期就被检出就医,其五年存活率可升至70%-80%。无论是高恶性的肺癌,还是恶性程度较低的乳腺癌和前列腺癌,早诊早冶都将大幅延长患者的生存时间,早诊早治的现实意义不言而喻。因此,癌症早期发现是问题的关键之一。 3、癌症治愈率早期发现与晚期发现的比较
胃癌,肝癌,肺癌,食管癌,结直肠癌,子宫颈癌,鼻咽癌,乳腺癌中国八大种癌症,这八大种癌症占发病率的80%。表一比较了几种主要癌症早期发现和晚期发现的五年存活率。早期被发现的癌症患者其(计入发病率权重的)
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五年存活率平均是晚期被发现的癌症患者的三倍以上。对胰腺癌、肺癌、肝癌而言,早期被发现的癌症患者五年存活率是晚期被发现的四至五倍,甚至更高。癌症早期检出不但能大大提高患者存活率,而且能大大降低治疗的费用。
表一. 几种主要癌症早期与晚期发现的五年存活率比较。
癌症名称 胰腺癌 肺癌 肝癌 胃癌 卵巢癌
晚期发现
早期发现 平均
30 70
8 13 14 23
五年存活率%
7 11
15 20
60 80 90 95 100 >65
子宫颈癌 20 乳腺癌
65
80 85 91
前列腺癌 32 平均
*计入发病率权重
*
<20
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二、癌症检测技术的现状及其局限性
目前,医院、诊所广泛使用的癌症检测技术主要有图像和生物生化两大类。
1、图像类:以“电子计算机断层扫描”(Computel Tomography, 简称CT),正电子发射计算机断层显像(Positron Emission Tomography, 简称PET), 和磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging, 简称MRI),为代表。CT结合X射线与电子计算机,能观察到某一个平面上横截面上各种组织,CT主要用于对各科观察诊断提供图像帮助;PET是利用特征性的药物(用放射性同位素标记)注入体内,在体外无创伤、定量、动态地观察这些物质进入人体后的生理、生化变化的成像,来诊断癌症;MRI是根据水分子的氢核在磁场作用下,能产生能级间的跃迁的原理而采用的一项新检查技术。 与CT和PET相似, MRI 也是为诊断提供图像帮助。CT需借用放射射线(X光)成像, 常用可能诱发癌症;PET的分辨率低,因此只能有效检测到1.5厘米以上大小的肿瘤,且有放射性比CT危害性还大。MRI分辨率比PET高但比CT低,成像质量受呼吸及人体器官的蠕动影响. 因此,CT,PET,和MRI图像检测癌症尚未被广泛应用于规模筛查/普查, 局限用于癌症临床的诊断。
2、生物生化类:主要包括血清肿瘤关联抗原和临床生化指标检测。血清肿瘤关联的抗原主要有CA15-3(肿瘤抗
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原15-3)、 CA242(肿瘤抗原242)、CEA(癌胚抗原)、 NSE(神经元特异性烯醇化酶)、CA19-9(肿瘤抗原19-9)、CA125(肿瘤抗原125)、free-PSA(游离前列腺特异性抗原)、PSA(前列腺特异抗原)、AFP(甲胎蛋白)、β-HCG(绒毛膜促性腺激素β亚基)、Ferritin(铁蛋白)、HGH(人体生长激素)等。生化指标种类繁多,主要包括血清酶活性指标(血清 r-谷氨酰基转移酶GGT、血清碱性磷酸酶ALT(AKP)、血清乳酸脱氢酶 LDH、血清淀粉酶AMY,等),和血清有机物和无机离子指标(血清直接胆红质DBIL、血清尿素氮BUN、血清总蛋白TP、血清钙Ca、血清磷PHOS、血清镁Mg、纤维蛋白原FIB,等)。
生物生化技术指标被广泛用于临床诊断参考,但独立作为癌症诊断依据,特异性均不足。综合多个常规肿瘤抗原指标和生化指标或许可提高检测特异性和灵敏性,但可提升的空间有限,因为现有的抗原为数不多,而且它们之间的相互关系及与癌症关联的机理尚待澄清。
三、分子生物学癌症检测技术背景
1、分子生物学检测技术
分子生物学检测技术正成为新兴的癌症检测研究开发方向,以弥补图像仪器及生物生化指标的不足。简言之,分子生物学癌症检测技术是在DNA、RNA和蛋白质水平上,
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通过分析这些生物分子的生物信息的相互关系及与癌症的关系,推测癌症发生机理,并以此为依据建立预测癌症的方法。分子生物学癌症检测技术采取更广阔的视野,从基因组角度、基因多态性角度、机体代谢途径角度、基因调控角度、基因突变角度、传统生理生化角度,去审视和解析癌症发生机理,进而指导癌症检测技术研发。分子生物学检测技术集结了大量与癌症发生相关的生物信息,将癌症检测信息化、系统化,以应对癌症发生的复杂性,使癌症检测更科学,基础更坚实。 2、DNA芯片技术
宫颈癌检测是目前分子生物学检测技术最为成功的例子。宫颈癌是由人类乳头状病毒(HPV)引起的,人类70多种乳头状病毒中有13种与宫颈癌的发病有关,检测出妇女是否染有这13种病毒可较准确检出是否有宫颈癌或患宫颈癌的风险。该检测技术就是通过检测这13种病毒特异RNA来预测这些病毒的存在,进而检测是否患宫颈癌。如果尚末患癌,仍可通过检测受检者的基因p53是否Arg72基因型来预测受检者在该病毒存在的情况下患宫颈癌的风险。
相对于多数其它癌症,宫颈癌致癌机理相对简单。因此,检测其它癌症的难度不可与检测宫颈癌相提并论。癌症发生的机理非常复杂,牵涉到几种,几十种,甚至几百种基因的突变或者失调,因此,仅用为数不多的标记物,
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很难同时准确检出大多数癌症。只有对尽可能多的这些突变或失调基因或基因产物进行检测,统计分析, 才能对大多数癌症进行诊断。但同时检测大数量基因或其产物,工作量非常庞大,传统的研究分析策略已经不能适应需要高度信息化的癌症检测要求。高通量生物芯片的应用使同时检测庞大数量基因或其产物成为可能。在过去的十几年,生物芯片技术受到包括生物医学的生物学界,分子生物学界的广泛重视,吸引了大量研究人力物力财力。
生物芯片包括DNA芯片和蛋白芯片。DNA芯片主要有二种, 基因表达微阵列和多态性DNA标记物微阵列。基因表达微阵列DNA芯片常常承载基因PCR产物,cDNA克隆,或寡聚核苷酸,去检测相应信使RNA的量; 多态性DNA标记物微阵列DNA芯片则一般承载包含多态性的寡聚核苷酸,去检测相应的基因多态性。最近又有两项DNA芯片技术的研发受到重视。它们是DNA修饰(主要是DNA甲基化修饰)芯片技术和微小RNA(microRNA) (或RNA干扰)芯片技术。DNA芯片可以纳入数千,甚至数万基因或DNA标记物,一张芯片上包含庞大的与研究相关的数据点,借助专业化复杂的统计分析,这些高通量生物信息可引导我们打开一道又一道神秘的生命之门。
DNA 芯片技术已迅速被应用于癌症研究,基因表达芯片已被广泛用于揭示癌症相关基因在癌症病人与正常人中
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的差异表达;SNP芯片也已被广泛用于研究基因的多态性与患癌的关联。研究人员试图以此为依据去检测癌症,DNA芯片有望成为癌症检测的另一条途径。 3、DNA芯片技术的局限性
DNA芯片虽然有可能替代传统的癌症检测手段,但这一技术有其先天不足之处。用于与芯片上的DNA杂交的核酸一般来自正常体细胞,而非来自癌细胞,因为在进行分析时尚不知受检者是否患有癌症,检测人员更无法获得受检者的癌组织,因此DNA芯片技术只能检出受检者的正常体细胞的基因表达和基因型,以及其基因表达和基因型诱发癌症的风险高低,为高危群体提供预防建议和措施,但不能达到通过检测基因突变及其表达产物来检测受检者是否已经患有癌症的目的。虽然通过检测受检者体液,分泌物,或排泄物中的脱落的癌症细胞可以直接检出癌相关基因的表达,但是,能够检测出体液、分泌物或排泄物中的脱落的癌症细胞的阶段,往往已是癌症晚期。 4、蛋白芯片技术
为弥补不能及时、直接检出癌症细胞引发的基因表达的变化的弱点, 蛋白芯片应运而生。蛋白芯片分为普通蛋白芯片、抗体蛋白芯片和抗原蛋白芯片,用于癌症检测的主要是抗体蛋白芯片和抗原蛋白芯片。抗体芯片承载与癌症相关的抗体,去检测受检者相应的癌症抗原以达到检测
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癌症的目的。抗体芯片技术快捷、方便,但依赖于抗原。抗体有相应的抗原,只有在得到抗原之后,才能用抗原去生产相应的抗体,因此,在得到与癌症相关的抗原之前,无法得到相应的抗体。如前面所述,现有的癌症抗原为数不多,如CA-125,PSA等,常做为癌症检测的指标,为诊断癌症或癌症复发提供参考,但单独用于癌症检测,特异性不足;而且,抗原在体内不如抗体稳定。现有抗体芯片解析癌症的能力有限,真正的临床检测准确率有待观察。
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第三章:抗原蛋白芯片癌症早期检测技术介
绍
目前针对包括肺癌在内的多数癌症尚无准确率高,无创伤,方便,低成本的早期检测方法。开发“抗原蛋白芯片癌症检测技术”的主要目标就是开发准确率高、无创伤、方便、低成本癌症早期检测技术手段。
一、抗原蛋白芯片癌症检测技术的机理
本项目将要开发的技术,“抗原蛋白芯片癌症检测技术”,是用抗原蛋白芯片检测血液抗体,达到发现早期癌症的目的。该芯片上承载几千种与癌症相关的抗原蛋白,去检测受检者血液 (1毫升的新鲜血液) 中相应的抗体,根据各种癌症相关抗体的数据,做出受检者是否患癌的判断预测。
“癌症抗原蛋白芯片癌症检测技术”从大量的癌症基因入手, 从癌症病人的癌症组织中分离出癌症相关基因,将这些分离得到的基因插入病毒载体后表达,并用独特的方法筛选出与癌症相关的表达产物, 并将这些表达产物作为抗原点在硝酸纤维素玻璃基片上,用此芯片检测受检者血清中的抗体,对检出数据进行统计分析, 检测癌症。癌症的发生可以是因为家族遗传的原因, 患者继承了父母的癌症基因; 也可以是因为癌症病毒的感染, 如乳头状瘤病
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毒(HPV)感染引起子宫颈癌; 也可以是因为环境因素引起的基因突变累积或基因自然突用被变积累。 但无论何种原因, 癌症必须通过改变基因表达产物或改变基因表达的调控而实现。 这些被改变的基因产物或失调基因的超量表达的产物, 将被机体免疫系统视为外源抗原而引发人体免疫反应产生抗体, “癌症抗原蛋白芯片癌症检测技术”就是用这些被人体人体视为外源抗原的蛋白检测这些抗体达到检测癌症。
二、抗原蛋白芯片癌症检测技术的研发进展
目前,美国的三个研究团队在研发抗原蛋白癌症检测芯片这一领域处于世界领先地位,他们分别是威恩州立大学医学院,密执根大学医学院,肯德基大学内科医学系。密执根大学医学院和肯德基大学内科医学系的技术均来源于威恩州立大学医学院,他们在这一领域的研究骨干,均师出威恩州立大学医学院。威恩州立大学医学院早在2002年已开展这项研究,研究范围涉及卵巢癌,乳腺癌,结肠癌,头脖癌,肺癌。密执根大学医学院和肯德基大学内科医学系2004年开始分别立项利用该技术研究前列腺癌、乳腺癌和肺癌检测。肯德基大学内科医学系从4000抗原克隆筛选出212免疫蛋白抗原,结果显示特异性和灵敏性分别为90%和95%。而如果用“留一在外”(leave-one-out)的
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分析分法分析以上整个81个血清样本, 则得到准确率为88.9%的结果。密执根大学医学院的研究用了共257个血清样本(119前列腺癌和138正常)。他们从2304个抗原克隆筛选出22抗原克隆并以此建立统计模型,持异性和灵敏性分别达到88.2%(95%置信区间为78%-95%)和81.6(95%置信区间为70%-90%)。威恩州立大学医学院用80个建模血清样本(39头脖癌,41正常)从5133个抗原中筛选出130个与头脖癌血清有反应的抗原克隆,并以此建立统计模型去检测验证样本(80头脖癌,78正常),准确率达到82.9%。他们还用71个建模血清样本(32卵巢癌,18卵巢良性肿瘤,25正常)从480个抗原中筛选出65个与卵巢癌血清有反应的抗原克隆,并以此建立统计模型检测验证样本,这一研究的特异性达到95%,但灵敏性只有55%。
三个研究团队的研究结果受到美国国家早期检测研究网络(Early Detection Research Network(EDRN))的高度重视,该技术在其多年来癌症早期检测研究开发总投入十几亿美元中占有重要组成部分。2006年底,EDRN组织了一次单盲测试,上述的三个研究团队参加了这次测试。在这次测试中,EDRN提供给上述团队各200血清样品(结直肠癌患者和正常人各若干),要求各团队用自己的方法,用半年到一年的时间,预测每个样品来自癌症患者或正常人,再把预测结果提交EDRN,最后集中开会宣布结果。结果每个
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团队预测的准确率都未能达到原定指标。深究他们失败的原因,乃该技术还存在一系列缺陷,这些缺陷是这次测试失败的直接原因, 这些缺陷也限制了该技术进一步走向产业开发。这三个团队现在仍被这些缺陷所困扰,茫然不知所措。这些缺陷中,最主要的两个是: 第一,该技术还欠缺稳定性,两个完全独立的实验,可得到差异很大的结果;第二,芯片上数据点之间变异大大高于抗体个体间的变异,从而大幅降低预测的准确率。
三、本项目研究团队抗原蛋白芯片癌症检测技术的独创性
与上述美国的三个团队不同的是,我们团队成员知识面宽广,兼有美国遗传学博士、美国应用统计学硕士、荷兰分子生物学硕士,在欧洲、美洲十多年留学期间,一直从事生物标志物研究,因此具有多门交叉学科的分析判断能力。该团队利用拥有多学科知识和经验的优势,经过十多年在国外潜心研究探索和积累,在抗原蛋白芯片癌症检测技术上取得突破,发现了抗原芯片走向产业化的主要技术缺陷,并解决了这些主要技术缺陷。与上述三个团队不同的还有,本团队直接动手和负责抗原芯片包括文库构建、克隆筛选、芯片制作、克隆血清杂交、图像扫描、数据读取、统计分析的每一个环节的实验和分析,对抗原芯
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片技术的每一环节都有亲身的体验和经验。该团队制作和得到的芯片扫描图,图像清析、点阵整齐、背景信号小、阳性信号强、重复信号接近、同一样品芯片间重复性高,这些高质量数据点为准确检测提供了良好基础。该团队还首创性地将拉丁方实验设计应用于芯片点样的实验设计,这样大大消除了同一芯片上各点间的变异(行间变异,列间变异),突显抗体结合样品间的差异反应,从而大幅提高检测的准确率。该团队还首创性地用多模型交互验证(Multimodel Cross-Validation)统计策略替代传统的单模型交互验证策略,用几千个统计模型同时预测一个样品,从而为每一个未知样品得到更加准确的无偏估计(unbiased estimate)。该团队还将统计学的包裹(bagging)技术用于癌症预测,进一步提高准确率。该团队这些独创的思路和方法,成功地解决了上述三个团队均未能解决的问题,得到的结果重复性高,两个完全独立的实验,可得到相似的结果; 成功地缩小系统和随机误差,得到较高的、可靠的预测准确率。下图为该成员负责的肺癌项目的癌症病人和正常人蛋白芯片四个亚方格(一张芯片共有4X8=32个亚方格)的扫描图。该图显示癌症病人和正常人的血清与抗原蛋白的明显差异反应,每个抗原蛋白在每张芯片上有四个重复。
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第四章: 项目开发阶段及投资需求
一、项目开发阶段
项目开发阶段从300平米实验室建设完毕起始,本项目总共由四个开发阶段组成。本项目的开发是在已经得到肺癌检测小试结果(准确率85%)的基础上进行的,因此重复肺癌结果,得到肺癌检测系统平台为第一阶段。在第一阶段的基础上,第二阶段的任务是将技术向肝癌、胃癌、结直肠癌、乳腺癌、和食管癌扩展,得到能同时检测这六种癌症的检测系统平台。第二阶段为小规模(年产100万片)生产蛋白芯片,小规模提供区域性癌症检测服务。第三阶段为大规模(年产1000万片)将癌症检测服务向全国辐射。建议以循序渐进、但各阶段紧密相连的方式向前推进,最终实现本技术在全国(全世界)的应用。整个项目开发时间将有六年的跨度。阶段与阶段间有部分重叠。表二列出了各个阶段跨越的时间;表三列出了各开发阶段需完成的任务及资金需求;表四列出了年产30-1000万片芯片产品厂房及人员需求。
表二、项目各开发阶段时间跨度图示
第一年 第一阶段 第二年 第三年 第四年 第五年 第二阶段 23 页 共68页 第
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第三阶段 预备阶段:装修实验室、购买仪器设备。
第一阶段:重复肺癌结果,并将技术向肝癌、胃癌、结直肠癌、乳腺癌、和食管癌扩展,得到能同时检测这六种癌症的检测系统平台,时间跨度2年。
第二阶段:小规模(年产100万片)生产蛋白芯片,小规
模提供癌症检测服务。时间跨度1年半。
第三阶段:为大规模(年产1000万片)癌症检测服务,为
将癌症检测服务向全国辐射,时间跨度一年半。
表三、各开发阶段需完成的任务及资金需求(万元人民币):
阶段 第一阶段 2年 任务 (假300平米设实验室装修就绪,) (仪器设备购置,需2个月安装设备) 肺癌、肝癌、胃癌、结直肠癌、乳腺癌、和食管癌抗原蛋白克隆获得,克隆筛选,第一代芯片血清杂交,数据读取分析,建模预测,蛋白克隆序列分析; 方法专利申请; 第二代(验证)芯片血清杂交,数据读取分析,建模预测; 肺癌、肝癌、胃癌、结直肠癌、乳腺癌、和食管癌标志物专利申请; 临床测试,申请药监局批文。 24 页 共68页 第
资金需求 装修60 仪器510 运转费1110 合作开发早期检测癌症抗原蛋白芯片技术商业计划书
第二阶段 一年半 (按100万片计) 1600平米厂房、生活区、及配套实施建筑装修,仪器设备购买安装,招募人员,建立管理体系,组织生产。 第三阶段 10000平米厂房、生活区、及配套实施建设装(按1000修,仪器设备购买安装,招募人员,建立管理万片计) 体系,组织生产。 一年半 总计 建设560 仪器3690 运转1040 产房3360 仪器3200 运转2000 44630 总投资需4亿4630万元。
表四、年产10-1000万片芯片成品厂房及人员需求
芯片数 厂房面积(平米) (万片) (低限) 30 240 100 1600 1000 10000 设备投资人员 人员 (万元) (大学毕业) (高中毕业) 1200 3 9 3000 30 50 30000 50 200
二、第一阶段肺癌抗原蛋白检测芯片产品临床前阶段开发进度
抗原蛋白癌症检测芯片的开发拟分阶段进行,首先开发肺癌抗原蛋白检测芯片。
抗原基因文库构建 0.4年 抗原基因筛选 0.2年 抗原克隆芯片构造 0.1年
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抗原血清杂交 0.5年 基因克隆选择分析、癌症统计模型建造 0.2年 检测特异性、灵敏性测试 0.2年 独立实验检测特异性、灵敏性测试 0.2年 综合统计分析,完成临床测试前所有实验 0.2年
抗原基因文库构建
抗原克隆筛选 抗原克隆芯片构造
0.5年
1.0年
1.5年
2.0年
抗原血清杂交
基因克隆选择分析, 癌症统计模型建造
检测特异性, 灵敏性测试 独立实验检测特异性, 灵敏性测试 综合统计分析,完成临床测试前所有实验
开发进度有约0.5年的误差, 最快1.5年,最慢2年半,可完成临床测试前所有实验。
三、完成各开发阶段的成果和意义
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1、第一阶段:重复肺癌结果,将技术向肝癌、胃癌、结直肠癌、乳腺癌、和食管癌扩展,共需投入1680万元 最快1.5年,最慢2年半,正常2完成第一阶段的任务:早期癌症检测准确率达到85%以上,争取达到90%。完成申请这6种癌的专利。
完成第二阶段的任务后,我们将获得:1) 一组相应癌症(肺癌、肝癌、胃癌、结直肠癌、乳腺癌、或食管癌)的抗原蛋白生物标记物;2)建立与该组抗原蛋白生物标记物相匹配的一套完整的分子生物学实验方法和数据统计分析流程;3)一套检测早期相应癌症的临床分析检测系统平台和相应的试剂盒;
完成第二阶段任务的意义:1) 可保证公司在技术与专利上远远领先将来可能的竞争对手;2) 知识产权的价值12亿元(取决于每各癌症技术的准确率,如准确率85%值2亿元,90%值3亿元);3)这些技术将改变世界现有早期肿瘤检测方法,并将影响相关治疗过程,费用及存活率。产生一定的社会影响。
3、第二阶段:临床测试,申请药检局批准与小批量生产,再需投入5590万元。
投入300万元用于临床测试与申请药检局批准。 加50名员工 ,20台点样仪,在1600平方米标准生化实验
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室内,每年可生产100万抗原蛋白芯片。用一年半时间完成第二阶段的所有任务。
在不能批量生产前,每个芯片应卖500至700人民币而不是三,四百人民币,因为我们有超越当前世界水平的技术,可以定价。
表五、小规模芯片生产规模效益测算
产量 销售(万片/价格 年) (元/片) 10 500 30 500 50 500 销售 收入 (万元) 5000 15000 25000 单位 成本 (元/片) 200 200 200 生产 成本 (万元) 2000 6000 10000 利润 总额 (万元) 1940 5970 9900
*注解:以上仅仅是基于每片出厂价500元预测的效益。并没有包括如果建立检测服务销售网所需的投资及可能的回报。因为不同的检测服务销售模式差异巨大,必须经过市场的验证方可大面积推广。现暂不予以考虑。因小批量主要针对相对富裕的人群,零售价在700-900元之间比较合理(与现在的核磁共振价差不多)。
完成第二阶段任务的意义:1)药检局批准;2)得到初步经实践检验的结论哪种检测服务销售方法更适用于中国。3) 使公司自负盈亏,公司每年获得5亿元总产值,9900万元人民币的利润总额。就算没有外部资金投入,公司也可以从银行直接贷款不断“自然”地向前发展(要超高速发展,或成为世界级公司5290万人民币是远远不够
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的)。
3、第三阶段:年产1000万片肺癌抗原蛋白芯片,再需投资3亿7360万元人民币
如果有准确率高、能早期检测、无创伤、价格适中的早期检测手段,在全国范围筛查癌症发病高危人群势所必然。高危人群包括:1)有家庭癌症遗传病史;2)易诱发癌症职业行业的从业者;3)年龄50岁以上者;4)吸烟者。保守的估计,高危人群的总数也要超过三亿人。即使每年只有三十分之一的高危人群参加筛选,每年至少也有一千万张芯片的需求;如果每年有十分之一的高危人群参加筛选,每年至少就有三千万张芯片的需求。
表六、年产300-1000万片肺癌抗原蛋白芯片成品厂房,设备需求投资粗略估算
年产300-1000万片芯片成品厂房,设备需
求
芯片数(万片) 300 1000
厂房面积(平米)(低限) 2400 8000
设备投资(万元) 3000 30000
人员(大学毕业) 40-60 60-80
人员(高中毕业)
60-120 180-220
表七、批量生产肺癌抗原蛋白芯片生产规模效益测算(基于每片出厂价300元)
产量 销售(万片/价格 年) (元/片) 100 300 300 300 500 300 销售 收入 (万元) 30000 90000 150000 单位 成本 (元/片) 200 190 180 生产 成本 (万元) 20000 57000 90000 利润 总额 (万元) 4700 16890 32400 29 页 共68页 第
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800 1000 3000 300 300 300 240000 300000 900000 160 150 150 128000 65210 150000 89850 450000 278850 用2年时间完成第三阶级的所有任务。
完成第三阶段任务的意义:成为中国知名企业。按照年产一千万片计算,公司每年获得30亿元总产值,89850万元人民币的利润总额。
第
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第五章:市场需求预测
对抗原蛋白癌症早期检测芯片市场需求与多个因素相关,其中主要包括:1)癌症发病率现状,治愈率现状;2)国家、人民生活水平高低、富裕程度;3)高危人群数量;4)检测消费价格。
一、癌症发病率现状,治愈率现状
据世界卫生组织估计,中国现阶段癌症发病率在每年新增400万左右,随着中国生活环境的恶化,这个数字正呈现以每年10%-15%的速度逐年递增。未来的几年,每年新增癌症病人将迅速超过500万。在中国,由于没有有效的早期检测手段及先进的术后辅助治疗,癌症总体治愈率不足50%,近年每年因癌症死亡的人数达200万人以上,这个数字还在随着发病率的攀升而逐年不断扩大,癌症已经上升到因病死亡的第一位。癌症已经成为全中国乃至全世界人民健康的第一大威胁。降低癌症死亡率是全社会亟待解决的问题。
二、国家、人民生活水平高低、富裕程度
随着中国经济近年的高速发展,国家越来越富裕,人民生活水平日益提高,人民收入日益增加。人民的身体健康保障日益受到严重关注,做为人民健康的第一大威胁的癌
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症首当其冲,有效遏制癌症死亡率已经是政府和人民的共识。筛查高危人群是有效遏制癌症死亡率的有效途径。
三、高危人群数量
为了有效遏制不断扩大的癌症死亡率,如果有准确率高、能早期检测、无创伤、价格适中的早期检测手段,在全国范围筛查癌症发病高危人群势所必然。高危人群包括:1)有家庭癌症遗传病史;2)易诱发癌症职业行业的从业者;3)年龄50岁以上者;4)吸烟者。保守的估计,高危人群的总数也要超过三亿人。三亿人的潜在需求是巨大的。
四、检测消费价格
用抗原蛋白芯片检测早期癌症,所需费用总共为500元人民币。普通的CT也需要约300元人民币,核磁共振约需600元人民币,PET更是需5000元人民币以上。相比之下,抗原蛋白芯片检测早期癌症的费用(500元人民币)属适中。中国人民越来越富裕,癌症高危人群将有经济实力为免除自己健康的第一大威胁每人每年支付500元人民币。
五、结论
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总而言之,癌症现阶段在疾病中的第一高发病率和第一高死亡率决定了癌症早期检测具有无可估量的潜在市场需求。国家、人民、癌症病患已经拥有承担癌症检测消费的经济实力,正急切盼望癌症早期检测技术早日诞生应用。只要尽快开发出高检测准确率、每片500元(初期价格)或300元(后期价格)价格的产品,市场的潜力是巨大的。即使每年只有三十分之一的高危人群参加筛选,每年至少也有一千万张芯片的需求;如果每年有十分之一的高危人群参加筛选,每年至少就有三千万张芯片的需求;如果每年有三分之一的高危人群参加筛选,每年至少就有意一亿张芯片的需求。
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第六章:风险评估及风险管理
任何开发项目都存在一定的风险,高科技项目更是如此。风险评估和管理的关键是事先预见潜在的风险,正确评估潜在风险的高低,做好风险管理和应对。
一、可能存在的风险
1、 在本项目产业化之前,是否会被其它科研机构或公司率先开发出检测平台抢占先机?该项目第一阶段完成临床前实验约需2年,临床验证约需0.5年到1年,在此期间其它科研机构会否率先有更具实质性的突破,其它科研机构会否有更新更先进的检测方法推出,从而对本项目的产业化构成威胁,使我们的项目不再具有产业化的经济价值和社会价值而夭折。
2、 我们目前的结果来源于已经确诊的癌症病人和健康对照的群体,二者的比例约为1比1(大约一半癌症病人,一半健康对照)。但临床筛查的高危人群,癌症病人与正常人的比例虽然高于自然群体的约千分之三,但亦远远小于1比1 (一般在一比几十 到一比几百之间,例如百分之一)。对于这种比例迥异的群体,我们的检测平台是否还能保持同样的检测准确率、灵敏性、和特异性?
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二、风险管理和对策
对于是否会被其它科研机构或公司率先开发出检测平台抢占先机问题,我们有充分的自信率先开发出检测平台,其它科研机构或公司率先开发出检测平台抢占先机的可能性很小,因为我们的技术大大领先于当前国内国际最高水平。即便如此,我们还是要密切跟踪国内国际其他公司的研发开发动向,争分夺秒、只争朝夕,抢时间争速度,尽早开发出我们的检测平台。
针对高危人群中癌症病人与健康人比例远低于我们的测试样本的疑虑,我们做了针对性实验,人为调整预测样本中癌症病人与健康人比例分别至1比5至1比100,模拟高危人群的比例,发现检测准确率、灵敏性、和特异性均未发生显著变化。但我们尚未检测过实际的高危人群,还不能100%确定不存在这样的风险。万一这种情况发生,我们可以只针对影像技术诊断的疑似癌症病人人群的人群进行筛查,或只针对医生怀疑有癌症的高危病人进行检查。
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第七章: 公司管理结构和人员编制
人员编制将随着开发的向前推进不断扩大。开发第一阶段和第二阶段所需人员较少,多为研发人员。在这两个阶段,由于人员少,易管理,管理结构简单,此时不需要专门的管理部门。第三阶段和第四阶段所需人员增多,且多为生产人员和销售人员,需要加强管理增加管理结构的层次,因此增加管理部门、公关部门、市场部门、和销售部门。
一、开发第一阶段管理结构和人员编制
1、管理结构
股东大会 董事会 总经理 研发部
样品科 生物技术科 芯片科 统计分析科 2、人员编制,定员:27人
部门 办公室 管理人员 1 技术人员 36 页 共68页 第
一般人员 2 合作开发早期检测癌症抗原蛋白芯片技术商业计划书
样品科 生物技术科 芯片科 统计分析科 1 1 1 1 2 6 3 2 1 3 3
二、开发第二阶段管理结构和人员编制
1、管理结构
股东大会 董事会 总经理 办公室 研发部 生产部 销售部 市场部 公关部
总经理 副总 人事科 财务科 秘书 样品科 技术科 芯片科 分析科 采购科 技术科 质控科 生产科 客户科 供货科 分销科 信息科 策划科 规划科 公关科 保卫科 2、人员编制,定员:77人
部门 办公室 研发部 生产部 销售部 市场部 管理人员 6 2 3 2 1 技术人员 3 10 10 2 1 37 页 共68页 第
一般人员 3 6 10 10 2 合作开发早期检测癌症抗原蛋白芯片技术商业计划书
公关部 1 1 4
三、开发第三阶段管理结构和人员编制
1、管理结构
股东大会 董事会 总经理 办公室 研发部 生产部 销售部 市场部 公关部
总经理 副总 人事科 财务科 秘书 样品科 技术科 芯片科 分析科 采购科 技术科 质控科 生产科 客户科 供货科 分销科 信息科 策划科 规划科 公关科 保卫科 2、人员编制,定员:251人
部门 办公室 研发部 生产部 销售部 管理人员 6 2 8 4 技术人员 6 10 40 4 38 页 共68页 第
一般人员 6 6 200 40 合作开发早期检测癌症抗原蛋白芯片技术商业计划书
市场部 公关部 2 1 2 2 6 6
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第八章: 项目投资预算
一、开发第一阶段投资预算(1680万元)
1、固定资产及仪器设备
A、实验室装修、大型研发设备(一次性投入)418万元。 分类 单价 (万元) 300平米实验室装修 芯片点样仪 芯片萤光扫描仪 机器人分液仪 总计
B、普通研发大设备(一次性投入)112万元。 分类 单价 (万元) -80度低温冷冻箱 -20度低温冷冻箱 4度冰箱 超速离心机 离心机 台式离心机 4 1.2 0.1 10 3 2 40 页 共68页 第
数量 金额 (万元) 60 150 148 60 1 1 1 1 60 150 148 60 418 数量 金额 (万元) 4 4 2 1 1 1 16 4.8 0.2 10 3 2 合作开发早期检测癌症抗原蛋白芯片技术商业计划书
超纯水系统 PCR仪 点样仪辅助设备 制冰机 凝胶成像系统 紫外可见光度计 超净工作台 2 4 5 1.5 4 1.2 4 1 1 1 1 1 1 6套 1 1 2 4 5 1.5 4 1.2 4 2 6 2 0.5 5 10 培养箱、恒温箱、水浴 2 移液器 电子天平 灭菌高压锅 振荡器 、杂交工具 1 2 0.5 5 计算机软硬件、打印机10 等办公用品 其他仪器、用具 基本试剂 总计 固定资产共投资
2、经营费用 分类 单价 41 页 共68页 第
39.8 30
39.8 30 152 570万元
数量金额 合作开发早期检测癌症抗原蛋白芯片技术商业计划书
(万元/(年) 年) 开发试剂、基片、点样200 针 器械及设备维护 实验室常规运转费用 职工工资、福利、顾问 差旅费、交通费 其它费用(公关等) 总计 60 50 200 25 20 2 2 2 2 2 2 (万元) 400 120 100 400 50 40 1110 开发第一阶段投资总计1680万元。
二、开发第二阶段投资预算(5590万元)
开发第二阶段进入了小规模生产阶段,产房、设备、工资将是最大的费用。
固定资产投资,包括厂房、设备。 分类 单价 (万元) 厂房用地(10亩) 数量 金额 (万元) 60 520 厂房(1600平米)、生 活设施建设 42 页 共68页 第
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芯片点样仪 芯片点样仪配套设备 机器人分液仪 流动资金 其它费用(公关等) 总计 150 200 60 20 2 3000 200 120 300 50 4250
开发第二阶段经营费用,需准备一年的费用,一年后可周转 分类 单价 数量金额 (万元) 150 150 600 100 40 300 1340 (万元/年) (年) 器械及设备维护 厂房室常规运转费用 职工工资、福利 差旅费、交通费 其它费用(公关等) 临床测试 总计 150 150 600 100 40 300 1 1 1 1 1 开发第二阶段投资总计5590万元。
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三、开发第三阶段投资预算(3亿7360元)
开发第三阶段进入了大规模生产阶段,产房、设备、工资将是最大的费用。
固定资产投资,包括厂房、设备。 分类 单价 (万元) 厂房用地(60亩) 厂房(10000平米) 职工生活区(3000平米,包括宿舍、食堂等) 芯片点样仪 芯片点样仪配套设备 机器人分液仪 流动资金 其它费用(公关等) 总计 150 1000 60 200 5 30000 1000 300 600 100 35360 数量 金额 (万元) 360 3000
开发第三阶段经营费用,需准备半年的费用,半年后可周转 分类 单价 44 页 共68页 第
数量金额 合作开发早期检测癌症抗原蛋白芯片技术商业计划书
(万元/年) (年) 器械及设备维护 厂房室常规运转费用 职工工资、福利 差旅费、交通费 其它费用(公关等) 总计 600 600 2200 400 200 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 (万元) 300 300 1100 200 100 2000 开发第三阶段投资总计3亿7360元。
项目总预算为4亿4630万元人民币。
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附录一、研发团队成员介绍
一、翁长仁博士介绍
1984北京大学植物生理生化学士毕业, 1994荷兰分子生物学硕士, 1999美国应用统计学硕士, 2000美国遗传学博士. 翁长仁为美国密西根威恩州立大学抗原蛋白芯片癌症早期检测与统计首席科学家,北京大学医学物理和工程北京市重点实验室客座教授。翁长仁掌握抗原蛋白芯片在癌症早期检测的所有最新技术,并有解决该技术实现产业化的完整方法。 这一超越世界水平技术的产业化将改变世界现有早期肿瘤检测方法, 并将取得良好的经济效益及产生一定的社会影响。
二、翁长仁博士简历
个人简历
个人资料: 翁长仁;电邮: cwenglive@live.com;. 电话:001 519 969
8527; 国籍:加拿大。
教育背景:
遗传学博士, 美国, 路易斯安娜州立大学1994-2000年; 应用统计学硕士, 美国, 路易斯安娜州立大学, 1997-1999年; 分子生物学硕士, 荷兰, 瓦赫宁恩农业大学, 1992-1994年; 植物生理生化学士, 中国, 北京大学, 1980-1984年。
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科研职务:
2002- 美国威恩州立大学医学院蛋白生物芯片技术首席科学家, 统计首席科学家.
2001-2002加拿大农业部温室及加工作物研究中心分子生物学实验室主任;
2000-2001 加拿大农业部温室及加工作物研究中心分子生物学实验室研究员;
1984-1992 北京中国农科院品种资源所,实习助理研究员、助理研究员。
中国兼职: 2009- 北京大学医学物理和工程北京市重点实验
室,客座教授。
专业学会会员:
2007- 2007-
美国癌症研究学会(AACR); 美国肺研究学会(ALA)
2000-2002 美国统计学会(ASA)。
美国自然科学基金特邀审稿: 2001- 大豆抗病基因芯片项目.
研究基金经费:
2001-2003 加拿大安大略大豆协会 OSG2001016 $128,000,
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Developing molecular markers linked to soybean
Phytophthora rot tolerance for marker-assisted selection in soybean breeding programs,主持人;
2007-2009 美国EDRN, 1R21CA100740-01, $200,000,Autoantibody
Biomarkers for Lung Cancer Early Detection. 技术负责人; 2003-2006 美国Michigan Life Sciences Corridor Grant,$3,000,000,
the development of new diagnostic tests, innovative surgical approaches and personalized medication for the treatment, prevention and eventual eradication of cancer,技术负责人。
发表的SCI文章 (为产业化癌症检测项目的目的,癌症检测方面
的文章暂时没有发表, 以下仅列出与生物标志物有关的SCI文章)
1、 Weng C , Yu K, Anderson TR, Poysa V. 2007. Mapping QTLs controlling tolerance to
Phytophthora root rot in soybean Conrad. Euphytica. 158:81-86. (通讯作者兼第一作者)
2、 Xiang-jun Shen, Rouba Fehmi-Ali, Chang-Ren Weng, Kuralay Hormont, Fazlul H.
Sarkar, David Grignon, and D. Joshua Liao. 2006. Loss of heterozygosity and microsatellite instability at the Xq28 and the A/G heterozygosity of the QM gene are associated with ovarian cancer. Cancer Biology & Therapy 5:523-528.
3、 M. Gijzen, C. Weng, K. Kuflu, L. Woodrow, K. Yu, and V. Poysa . 2003. Soybean seed
luster phenotype and surface protein co-segregate and map to linkage group E. Genome 46:659-664.
4、 Weng C , Kubisiak T, Nelson CD, Stine M. 2002. Mapping quantitative trait loci
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controlling early growth in a longleaf pine x slash pine bc1 family using RAPD markers. Theoretical and Applied Genetics 104:852-859. (通讯作者兼第一作者)
5、 Weng C, Yu K, Anderson TR, Poysa V. 2001. Mapping genes conferring resistance to Phytophthora root rot of soybean, Rps1a and Rps7, using microsatellites (SSR). The Journal of Heredity 92:442-446. (通讯作者兼第一作者)
6、 Huang CC, Cui YY, Weng CR, Zabel P, Lindhout P. 2000. Development of diagnostic PCR markers closely linked to the tomato powdery mildew resistance gene Ol-1 on chromosome 6 of tomato. Theoretical and Applied Genetics 101(5/6):918-924.
个人能力及特长:
1)具多学科知识面(分子生物学,肿瘤分子生物学,免疫学,遗传学,应用统计学,计算机科学)。分子生物学方面,接受了系统性分子生物学理论基础教育培训。肿瘤分子生物学方面,系统地自学了肿瘤分子生物学理论、癌症发生的基因基础。在应用统计学方面,系统性接受了美国大学十几门应用统计学课程教育。在计算机学方面,学习了四门欧美计算机理论或编程课程,自学或培训了三门计算机语言编程。
2)多学科综合灵活应用能力强,有独创开拓能力,尤其对分析解决技术问题有特殊的敏感。在分子生物学领域有十多年的工作经验,尤其在分子生物标志物及基因组领域功力深厚。对免疫学、癌症发生、及抗原抗体生物标志物的关系有独到见解。能根据生物芯片的具体情况,灵活运用统计学实验设计方法进行芯片实验设计;具有
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灵活运用统计学方法,根据复杂的生物学具体现象进行相对应分析的独特能力。能根据统计计算要求编写计算机程序,同时借用统计学应用软件,提高分析效率,编程能力强。
3)对抗原蛋白芯片技术具有细致、独到、透彻的见地。掌握抗原蛋白芯片在癌症早期检测的所有最新技术,并有解决该技术实现产业化的完整方法。 这一超越世界水平技术的产业化将改变世界现有肿瘤早期检测方法的格局, 并将取得良好的经济效益及产生巨大的社会影响。
4)具有开展用生物芯片开展癌症早期诊断的综合能力,并具有不断学习和知识更新、善于思考的长处,因此获得了与众不同的独特能力和不断积累起来的成果,这些能力对最终解决癌症早期检测这一世界难题具有非常重要的意义,一直在第一线从事实际工作,并具有带领一个团队攻克难关的能力。
技能:
生物标志物 (癌症抗原蛋白, SNP, SSR, SCAR, RFLP, RAPD, 等); 生物芯片技术 (芯片点样, 芯片扫描, 芯片图像定量,芯片数据常态化及分析,癌症检测分析);
分子生物技术 (DNA, RNA, 蛋白制备、纯化、及定量, Southern,
northern, Western, DNA测序, PCR, QPCR, RNA干扰, 细胞培
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养, DNA重组, DNA多态性, 基因克隆,基因表达, cDNA文库, DNA转化和传导, BAC DNA重组, 引物设计, 凝胶电泳, 等等);
生物化学技术 (HPLC, 凝胶层析, 离子层析, 等等);
计算机技术 (计算机原理,C语言编程、C语言高级编程和数据结
构,Pascal语言程、Basic语言编程, Acess, Excel, 等); 应用统计分析 (实验设计, 方差分柝, 回归分析, 非参数分析, 多元分析, 等);
统计学软件(SAS、R、S-Plus)。
工作经历:
一、2002-- 美国威恩州立大学医学院蛋白生物芯片技术, 统计首席科学家
负责:(1)抗原蛋白芯片癌症早期检测项目研发,筛选一组具
检测早期癌症功能的抗原蛋白生物标记物,用于筛查高危人群;(2)DNA多态性与前列腺癌复发流行病学研究;具体负责项目资金申请、实验设计、实验实施、数据统计分析、癌症检测建模及预测。
1、抗原蛋白芯片癌症早期检测项目技术负责人 主要研究成果:
筛选分离获得了几百个肺癌抗原蛋白标志物,并证明它们可以作为肺癌早诊和筛查的抗原蛋白标志物。建立完善了癌症抗原蛋白芯片
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合作开发早期检测癌症抗原蛋白芯片技术商业计划书
及其检测技术,包括肺癌早诊、癌前预警的抗原蛋白芯片技术及定量检测技术。建立抗原蛋白芯片实验设计、数据处理(克隆选择、数据常态化、系统误差较正、统计分析)系统平台, 建立高准确率、高可靠性的癌症检测分析系统。 这种检测技术高效、准确、简便、高通量、低成本, 受检者无痛苦, 可应用于大规模癌症高危人群筛查。
主要技术突破点
(1)、首创性地系统化整个抗原蛋白芯片肺癌早期检测技术,大大提
高检测准确性和稳定性;
(2)、成功地发现并攻克了克隆筛选,保持蛋白克隆活性,芯片点样
均一性,等技术难点;
(3) 、首创性地将拉丁方设计运用在芯片点样设计,消除部分空间排列变异,凸显差异反应;
(4) 、首创性地用多模型交互验证(Multimodel Cross-Validation)统计
策略替代传统的单模型交互验证策略,用几千个统计模型同时预测一个样品,从而为每一个未知样品得到更加准确的无偏估计(unbiased estimate);
(5)、 首创性地用单个基因克隆点样以解析蛋白芯片变异来源,以此
指导建立消除芯片变异方法。
2、DNA多态性与前列腺癌复发流行病学研究项目技术负责人
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主要研究成果:
CYP17/CYP3A4的变异失衡增加前列腺癌复发
首次发现CYP17/CYP3A4基因存在相互作用, 发现CYP17/CYP3A4的变异失衡增加前列腺癌复发机率显著高于CYP17/CYP3A4的变异平衡情况下的前列腺癌复发机率。该发观对传统的前列腺癌治疗方法提出挑战, 建议是否用传统的男性荷尔蒙烧蚀(androgen ablation)法
治疗需视患者基因CYP17/CYP3A4的变异平衡情况而定。
主要技术突破点
首次用统计学方法剖析了基因多态性之间的相互作用。
二、2000-2002,加拿大农业部温室及加工作物研究中心分子生物学实验室研究员(2000-2001)、实验室主任(2001-2002)
领导分子生物学实验室科研,申请科研经费;与加拿大农业部伦敦分子生物学研究所及加拿大农业部渥太华谷物研究所科学家协作进行大豆抗病基因研究;负责大豆品种(系)Conrad,OX760,OX281, Mukden, OX744抗疫病(Phytophthora Sojae)、抗白粉病基因的研究,抗疫病数量位点,抗疫病、抗白霉病基因图谱、基因组研究,鉴定大豆抗疫病品系OX744与疫病敏感品系之间差异表达基因,大豆抗疫病品系OX744的BAC文库构建。
主要研究成果:
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应用大豆微卫星DNA标志物技术, 建立了大豆抗疫病基因图谱。发现并定位了大豆品系OX281和Mukden携带的抗疫病基因Rps1a和Rps7, 二者存在于同一同源染色体MLG N, 相距约13.8cM的遗传距离, DNA标志物Satt159和Satt009与Rps1a紧密连锁, Satt125和Satt009与Rps7连锁。Satt159距Rps1a仅0.7cM遗传距离, Satt009也仅距3.2cM遗传距离。Satt159和Satt009对将来大豆抗疫病育种的后代标志物协助筛选, 以及协助和指引该抗病基因的克隆, 提供了重要工具。
三、1984-1992 北京中国农科院品种资源所,实习助理研究员、助理研究员。
大豆品种资源抗盐碱鉴定
承担国家”八五”攻关子课题”大豆品种资源抗课题盐减鉴定”, 主持协调全国大豆品种资源抗盐减鉴定工作, 主持完成一万份大豆品种资源抗盐碱鉴定入库。负责大豆抗盐碱生物学机理研究。
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