利⽤DAVID简单的进⾏GO富集度分析(这⾥只做简单的分析,即看基因是否存在在GO的三个过程⾥⾯)
⽐如我们有⼀组要分析的基因:TRPV6 CXADR PROM1 GRAMD2 SOX10 GPRIN2 VANGL2 GRHL1 BCL11A MROH8(这⾥⽤的是关于⼈的基因名)
⾸先打开DAVID⽹页,选择Functional Annotation:
在左边的框⾥⾯按提⽰输⼊,步骤1,输⼊你的ID号,这⾥可以是基因ID,也可以是基因名,或者是其它的,但是如果你是基因名,则在步骤2选择GENESYMBOL
选好后,点提交:
点击确定,就出现下⾯:
选择⼈类的类型(Homo sapiens),点击select Species:
点击右边的Gene_Ontology,在GO的三⼤类中,可以看出在BP中,我们提交的10个基因中有7个在BP中对应有GO Term项。同理还有CC,MF的也可以看出。本⼈还在学习当中,如有不对请指出。
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