建设用地上建厂房是违法的。任何个人和单位进行建设需要使用集体土地的，必须依照法律相关规定申请使用集体土地是也有例外的情况，比如说新办乡镇企业和村民建设住宅经依法批准使用本集体经济组织农民集体所有土地的，或者乡镇村公共设施和公益事业建设经依法批准使用农民集体土地所有的土地的除外。
申请办理建设工程规划许可证，应当提交使用土地的有关证明文件、建设工程设计方案等材料。需要建设单位编制修建性详细规划的建设项目，还应当提交修建性详细规划。对符合控制性详细规划和规划条件的，由城市、县人民政府城乡规划主管部门或者省、自治区、直辖市人民政府确定的镇人民政府核发建设工程规划许可证。 城市、县人民政府城乡规划主管部门或者省、自治区、直辖市人民政府确定的镇人民政府应当依法将经审定的修建性详细规划、建设工程设计方案的总平面图予以公布。
工业用地才可以建厂房。建设用地是否可以建厂房，需要看建设用地的批准用途。如果是批准的住宅用地或者其他使用用途，是不可以建厂房的。如果是批准的生产加工项目建设用地也要完成以下的手续才能建设：
1、完成建设规划审批，规划局负责审批；
2、完成建设项目的备案或审批，到项目政府主管部门办理；
3、环境影响报备或审批；
4、建设用地已经通过招拍挂，并加纳了土地的出让金签订了合同；
5、到政府建设部门办理了建设许可证或者开工许可证。
法律依据：
《中华人民共和国土地管理法》
第四十四条 建设占用土地，涉及农用地转为建设用地的，应当办理农用地转用审批手续。 永久基本农田转为建设用地的，由国务院批准。
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