发生纠纷公司法人跑了可以依照章程规定指定新的法定代表人，自变更决议或者决定作出之日起30日内向原公司登记机关申请变更登记。办理变更登记后，由新的法定代表人代表公司参与民事诉讼。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国公司法》第十三条公司法定代表人依照公司章程的规定，由董事长、执行董事或者经理担任，并依法登记。公司法定代表人变更，应当办理变更登记。《中华人民共和国公司登记管理条例》第二十六条公司变更登记事项，应当向原公司登记机关申请变更登记。未经变更登记，公司不得擅自改变登记事项。第三十条公司变更法定代表人的，应当自变更决议或者决定作出之日起30日内申请变更登记。
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