医保与农保不同如下：
1、概念不同
社会医疗保险亦称“疾病社会保险”或“健康社会保险”。被保险人因疾病、负伤、残废等造成收入中断及医疗费用的损失，由保险组织提供物质帮助的一种社会保险。
新型农村合作医疗是指由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。其采取个人缴费、集体扶持和政府资助的方法筹集资金。
2、参保对象不同
农村合作医疗指凡户籍在该地，出生90天以后的农村居民及没有参加城镇职工基本医疗保险的城镇居民均可参加、未参加城镇职工基本养老保险的农村居民，可在户籍地自愿参保。医疗保险是在参加工作的，有部分由自己缴纳，一部分由公司缴纳。
3、缴费费用和方法不同
农村医保缴纳的费用一年几百元，而社保缴纳费用一年几千甚至上万，相比之下农村医保的费用低很多。农村医保是由参保人负担全部费用，而社保是由职工和公司一起承担费用的。
城镇职工医疗保险按月缴费且设立最低缴费年限，达到缴费年限(男25年、女20年)的，退休后不再缴费即可享受基本医疗保险待遇。新型农村合作医疗是按年度缴费且要终身缴费，不缴费不享受待遇。
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