员工病假工资会扣五险一金。最低工资指的是扣除由个人承担的五险一金之前的工资。《关于贯彻执行《中华人民共和国劳动法》若干问题的意见》（劳部发1995309号）第五十九条职工患病或非因工负伤治疗期间，在规定的医疗期内由企业按有关规定支付其病假工资或疾病救济费，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。按照规定是包含的。病假期间公司也要依法为员工缴纳社保。
一、劳动法病假工资如何计算
在劳动法的相关法律规定中，病假的工资由用人单位来确定，可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。
根据《劳动法》第四十七条：用人单位根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平。
《关于贯彻执行若干问题的意见》的第59条规定，职工患病或非因工伤治疗期间，在规定的医疗期内由企业按有关规定支付其病假工资或疾病救济费，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。
二、公司无病假规定合法吗
病假是否国家规定的，而不是由单位制定的规定，私人企业的员工也是有休病假的权利的。
病假，是指劳动者本人因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，企业应该根据劳动者本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予一定的医疗假期。病假期劳动者可照常拿工资，对于病假工资，不低于当地最低工资的80％。
职工患病或非因工负伤治疗期间，在规定的医疗期内由企业按有关规定支付其病假工资或疾病救济费，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80％．
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