免疫共沉淀实验步骤:
1 将转染质粒48 h后的293T细胞用冰1×PBS洗涤一次,加入1ml预冷的IP buffer裂解液(含PMSF),冰上30min裂解细胞。
2将细胞裂解液收集于1ml EP管中,在4℃ 12000rpm离心10 min,取上清,加入4μg 抗体于4℃振摇2h(抗体的量和振摇时间可根据抗体特异性适当调整)。(阴性对照组为相同的种属的抗体)
3 样本组和对照组中分别加入50 μl prorein A/G 树脂在4℃振摇过夜。用IP buffer洗涤3次,每次4℃ 12000rpm离心5min,弃上清。加入40μl 2×上样缓冲液。沸水中煮10 min变性蛋白。取20μl蛋白样品上样,在SDS-PAGE后,转移质PVDF膜,用相应抗体进行检测。
IP buffer
20mM Tric-Hcl
137mM NaCl
10% Glycerol
1% Np-40
1mM EDTA
注意事项:
(1)细胞裂解采用温和的裂解条件,不能破坏细胞内存在的所有蛋白质-蛋白质相互作用,多采用非离子变性剂(NP40或Triton X-100)。
(2)使用明确的抗体,可以将几种抗体共同使用
(3)使用对照抗体:
单克隆抗体:正常小鼠的IgG或另一类单抗
兔多克隆抗体:正常兔IgG
(4)吸取珠子的枪尖最好将口开大(剪掉尖头部分),以免损伤珠子。
(5) 确保共沉淀的蛋白是由所加入的抗体沉淀得到的,而并非外源非特异蛋白,单克隆抗体的使用有助于避免污染的发生;
(6) 要确保抗体的特异性,即在不表达抗原的细胞溶解物中添加抗体后不会引起共沉淀;
(7) 确定蛋白间的相互作用是发生在细胞中,而不是由于细胞的溶解才发生的,这需要进行蛋白质的定位来确定。
(8)如何选择prorein A/G 树脂见abcam IP 实验步骤。
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