(12)发明专利申请
(21)申请号 CN201810422205.7 (22)申请日 2018.05.04 (71)申请人 温州大学
地址 325000 浙江省温州市瓯海区东方南路38号温州市国家大学科技园孵化器
(10)申请公布号 CN108763862A
(43)申请公布日 2018.11.06
(72)发明人 刘文斌;沈良忠;昝乡镇
(74)专利代理机构 温州名创知识产权代理有限公司
代理人 陈加利
(51)Int.CI
权利要求说明书 说明书 幅图
(54)发明名称
一种推导基因通路活性的方法
(57)摘要
本发明提供一种推导基因通路活性的方
法,包括获取样本及其对应的通路网络和各基因的表达值,并以基因t检验的t值和皮尔森相关系数为基因的权重对各基因的表达值进行加权处理;根据通路网络的拓扑结构,得到同一通路中基因之间相互作用类型及其对应的强度,并利用基因之间相互作用类型的强度和加权后的各基因表达值,得到各基因之间的互作表达值;整合各基因的表达值及互作表达值并采用主成分分析法
分析,且进一步将得到的第一主成分均定义为通路的活性分数。实施本发明,同时考虑基因的重要性和基因间相互作用的重要性来推断通路的活性,从而实现对生物通路样本状态的评价。
法律状态
法律状态公告日
2018-11-06 2018-11-06 2018-11-30
法律状态信息
公开 公开
实质审查的生效
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权利要求说明书
一种推导基因通路活性的方法的权利要求说明书内容是....请下载后查看
说明书
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