中国病原生物学杂志 2015年4月 第10卷第4期 Journal of Pathogen Biology April 2015,Vo1.10,No.4 ・ 377 ・ DOI:10.13350/j.cjpb.150421 ・综述・ D一氨基酸在生物膜分散中的作用研究进展 佘鹏飞,陈丽华,许欢,伍勇一 (中南大学湘雅三医院检验科,湖南长沙410013) 【摘要】细菌能粘附于物体表面而形成生物膜,生物膜的存在极大的增加了细菌的耐药性,常规抗生素难以清除生物 膜。近年来,科学家发现枯草芽孢杆菌生物膜成熟后期能自发分泌具有分散作用的 氨基酸,这些I)I氨基酸也能分散 葡萄球菌和铜绿假单胞菌的生物膜。I)I氨基酸对人体无毒,有望成为控制生物膜感染的新措施。 【关键词】生物膜;耐药;【)I氨基酸;L-氨基酸;枯草芽孢杆菌;综述 【中图分类号】R37 【文献标识码】A 【文章编号】1673—5234(2015)04—0377—04 [Journal oJ’Pathogen Biology.2015 Apr;10(4):377—380.] Effects of D-amino acids on disruption of bacterial biofilm SHE Peng—fei,CHEN Li—hua,XU Huan,WU Yong(Clinical Laboratory,The Third Xiangya Hospital。 Central South University,Changsha,Hunan 410013,China) [Abstract]Most bacteria are able to forming biofilms when growing on biotic or abiotic surfaces.The existence of a bio film greatly increases a bacterium's resistance to antimicrobials.Biofilms are bacterial communities held together by a pol— ymeric matrix.Over the past few years,scientists have found that Bacillus subtilis produces certain D—amino acids.and these amino acids act as a natural signal for disruption of mature biofilm by causing the release of the protein component of polymeric matrix.These D—amino acids can also trigger disruption of Staphy1oc。ccus and Pseudomonas aeruginosa bio— film.D—amino acids are synthesized and released by many bacterial species and have been found to lack significant toxici— ty,SO the hope is to use these amino acids to combat biofilm--associated infections. [Key words]Biofilm;drug resistance;D-amino acid;L—amino acid;Bacillus subtilis;review 细菌在自然界或人体内有两种存在形式,即浮游状态和 互融合形成j维结构;5)生物膜成熟后期:深层细菌因营养物 生物被膜(biofilm)状态。生物被膜相关理论由Bill Costerton 质缺乏、氧气不足等原因而死 ,并聚集;6)生物膜分散期:在 于1978年首次提 。随后,科学家发现生物膜广泛涉及包括 微菌落发育的后期,生物膜三维结构会出现一些空洞,最终微 医学、丁业、农业和工程学在内的多个领域,Bill Costerton也因 菌落顶部会破裂并散播游离“种子”,散播的“种子”一旦遇到适 其在生物膜研究中的突 贡献而被誉为“生物膜之父”Ill。 宜的环境将会重新粘附而形成新的生物膜[5]。生物膜形成及 生物膜相关感染非常普遍,如:隐形眼镜相关角膜炎、中心 分散过程都受到环境因素(如:噬菌体、毒素和其他原生动物 静脉导管相关感染、周同静脉导管相关感染、导尿管相关感染、 等)的调节,这些信号主要通过作用于群体密度感应(quorum 慢性鼻窦炎、肺囊性纤维化(cystic fibrosis,CF)以及伤口慢性 sensing,Qs)系统和(或)通过第二信使环鸟苷二磷酸(c—di~ 感染等I2]。常规的抗生素治疗常常难以根除生物膜菌,且因生 GMP)而发挥效应 ]。 物膜胞外基质的屏障作用,到达生物膜深层的抗生素常处于亚 2生物膜相关耐药机制 抑菌浓度,更容易诱发细菌耐药性的产生口 。这常导致感染迁 生物膜的耐药机制相当复杂,除了具备与浮游菌共有的一 延不愈,给临床治疗带来很大的困难。 些耐药机制外,还有其自身特异性的耐药机制。 1 细菌生物膜的形成 2.1 胞外基质相关耐药 富含多糖、蛋白质及eDNA的胞外 生物膜是细菌在不利环境下依附于某些载体表面,分泌胞 基质在生物膜表面形成了一层厚厚的生物屏障,阻碍抗菌药物 外多聚物(extracellular polymeric substance,EPS)和基质将自 的渗透。如:铜绿假单胞菌(Pseudomonasaeruginosa)的胞外多 身微菌落包裹,形成能抵抗外界不利环境包括抗生素在内的高 糖主要由Psi和Pel组成,研究发现pelA基因突变的铜绿假单 度组织化和系统化的膜性聚合物[4]。EPS主要由蛋白质、脂 胞菌对抗生素明显比野生型更敏感 ]。而粘液型铜绿假单胞 类、多糖和胞外DNA(eDNA)组成。生物膜的整个生理过程可 菌的胞外多糖除了Pel,Psi外还有由藻酸盐形成的粘液,进一 以大致划分为6个阶段:1)初始粘附期:单个的浮游菌游动并 步增加了生物膜的耐药性 ]。eDNA也是生物膜胞外基质重要 粘附于物体表面,此时浮游菌的粘附是可逆的,既可继续聚集 而形成生物膜,也可以从粘附状态返回浮游状态;2)微菌落形 成期:随着细菌不断粘附聚集而逐渐形成微菌落,此时细菌的 *【基金项目】湖南省自然科学基金(No.14JJ7015);中南大学研 粘附是不可逆的;3)生物膜形成初期:微菌落中的细菌相互作 究生自主探索创新基金(No.2015zzts323)。 **【通讯作者】伍勇,E—mail:wuyong xy@126.COI1] 用并传递信号对自身进行调节,使微菌落不断强大从而形成成 【作者简介】佘鹏飞(1991),男,湖南人,研究生在读。主要研 熟的生物膜;4)生物膜成熟期:微生物菌落持续发展增大并相 究方向:微生物耐药机制。E—mail:shepengfei—xy@126.corn ・ 378 ・ 组成成分之一,eDNA能诱导操纵子PA3552 3559的表达,这 些表达产物能介导生物膜对阳离子抗生素的耐药 。蛋白质 是构成生物膜的重要物质,在生物膜中除了有生物学功能的蛋 n之外,还有很多蛋白仅仅构成生物膜结构,这些蛋白质连同 胞外多糖和eDNA共同形成和维持生物膜的形态结构。 2.2生物膜能抵抗采自抗生素的氧应激包括 内酰胺类、 氟喹诺酮类和氨基糖苷类在内的抗生素都能通过诱导有细胞 毒性的活性氧(reactive oxygen species,ROS)(如:()2・ )的产 生而杀灭大肠埃希菌(Escherichia coli)和金黄色葡萄球菌 (Staphylococcus aureus) 。而生物膜菌中超氧化物歧化酶 (superoxide dismutase,SOD)和具有还原作用的谷胱甘肽的表 达都要比相应浮游菌高,这些物质能有效抵抗ROS的毒性作 用_】”],从而增加生物膜耐药性。 2.3基因表型的变异细菌的很多基因在细菌与固体表面相 互作用时受到了双向调节,因而使得生物膜菌基因表达与浮游 菌不同。在慢性肺CF患者中分离出的铜绿假单胞菌能形成小 菌落突变株(small colony variants,SCVs),SCVs也存在于体外 构建的生物膜模型,sCVs中的细菌生长缓慢,对抗生素极其耐 药。近年来,科学家发现,SCVs中的细菌高度耐药是由于多因 素多重基因突变使细蔺外膜的组成成分改变并使多重耐药的 外排泵表达增多[ 。此外,科学家在生物膜中还发现一种处于 休眠状态或缓慢牛长状态而没有基冈型改变的细菌且对抗生 素极不敏感,并命名为持留菌(persister)。持留菌存生物膜的 彤成中非常重要,是导致生物膜无法根除的主要原因。一旦这 些持留菌转移至有利环境可继续分裂增殖,形成新的生物 膜 。 2.4生物膜特异性耐药基因的表达 生物膜耐药性的产生一 部分是因为浮游菌的各种耐药表型几乎在生物膜中都有所加 强,另一部分来源于特殊的耐药基闵的表达。浮游状态下铜绿 假单胞菌中的ndvB基因能编码催化合成细胞壁重要成分cy— clic一0(1,3)一葡聚糖所需的葡糖基转移酶。而生物膜状态下的 ndvB则可以通过诱导乙醇氧化相关基因的表达而增加铜绿假 单胞菌的耐药性 ]。此外,生物膜状态下铜绿假单胞菌的操纵 子PA1875—1877可以分别编码外膜蛋白OpmI~ATP合盒 (ATP—binding cassette,ABC)转运体和一种外膜融合蛋白 HlyD同系物,这些成分组合在一起相当于外排泵,能介导铜绿 假单胞菌对妥布霉素和环丙沙星的耐药 。 3 I).氨基酸分散生物膜 自然界中存在的氨基酸以I 型为主。【)_氨基酸是通过相 应的L一型氨基酸存消旋酶或差向异构酶催化作用下使手性 一 碳原子消旋或差向异构化而形成,也可通过a一酮酸的胺化作用 产生J ]。细菌在静止期能产生I)I氨基酸,细菌体内的消旋酶 来自ylmE和racX突变体 ]。某些【)I氨基酸对细菌是有利 的,如: 氨基酸可以作为肽聚糖的重要组成成分;可以调节细 菌芽孢的形成等。若这些 氨基酸的合成受到影响将会导致 细菌死亡。然而.近几年科学家发现某些【)I氨基酸在抑制生物 膜形成或分散成熟的生物膜中具有很大的潜力 ̄1 7 1 8],有望成为 治疗生物膜感染的新措施。 3.1 D-氨基酸与枯草芽孢杆菌 I)I氨基酸的分散作用首次发 现于枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)形成的生物膜中llc]。枯草 芽孢杆菌是一类能产芽孢的益生菌,其研究已经有178年的历 中国病原生物学杂志 2015年4月 第io卷第4期 Journal of_Pathogen Biology April 2015,Vo1.10,No.4 史,能分泌多种低分子量的抗菌肽、细菌素等抗菌活性物质抑 制病菌的生长,其研究主要集中存T业发酵、食品保健、农业生 产和食品保健方面 ]。枯草芽孢杆菌能够在固体表面或气 液交界面形成复杂的生物膜,是研究生物被膜良好的模式菌 株。2010年Boles等口 首次发现其能自发性产生 氨基酸,不 但能有效分散自身生物膜也能分散铜绿假单胞菌和金黄色葡 萄球菌形成的生物膜。随后,有关【)I氨基酸的研究相继展开。 Boles等 发现,生长在液体培养基中成熟的枯草芽孢杆 菌生物膜能诱导自身分散,其上清液提取物仍然有分散作用, 随后对其进行分析、纯化发现这些效应物质是【)I氨基酸,且主 要是D一亮氨酸(D-I eu)、13-蛋氨酸(D-Met)、NI色氨酸(D-try)和 r)I酪氨酸(1 ̄try),这些 氨基酸能在毫摩尔甚至微摩尔数量 级水平下就能有效分散生物膜,然而相应的L型氨基酸不但都 没有分散效果,还能特异性的拮抗【)I氨基酸的作用 。此外, 其他类型的 氨基酸如 丙氨酸(D-Ala)、【)I苯丙氨酸(13- Phe)等却没有相应的分散效果。D一氨基酸分散生物膜的作用 主要是通过对细菌胞外蛋闩合成的毒性作用而完成,【)_氨基酸 能够抑制细菌的生长和产生物膜基质相关基因的表达(如epsA 和tapA)Ezs]。枯草芽孢杆菌生物膜的胞外基质主要由胞外多 糖和淀粉样纤维组成,淀粉样纤维由操纵子yqxM—sipW tasA 表达的TasA蛋白组成,TasA是一种使生物膜连接在一起的纤 维蛋白,对维持生物膜结构和功能有重要作用 , 。这些【)_ 氨基酸正是通过抑制TasA蛋白的表达并作用于YqxM蛋白 (纤维形成和定位所必须的蛋白之一)使YqxM蛋白在细胞壁 表面错误定位,最终使淀粉样纤维不能正常连接细胞壁而分散 生物膜口 。存随后的研究中发现D一氨基酸之所以能够分散枯 草芽孢杆菌的另一个重要原因是枯草芽孢杆菌的dtd基 发生 了突变。dtd基因编码D-Tyt—tRNA脱酰(基)酶,【)1Tyt—tRNA 脱酰(基)酶的主要功能是移除tRNA中错配了的D一氨基酸。 研究者发现在能被【)_氨基酸分散的枯草芽孢杆菌NCIB3610 中,编码D-Tyt—tRNA脱酰(基)酶的dtd基因起始密码子AUG 点突变成编码赖氨酸的AAG。D-Tyt—tRNA脱酰(基)酶受损 的枯草芽孢杆菌对错配入肽聚糖中的I)I氨基酸没有修复功能, 导致不能识别并纠正错误掺入肽链的 氨基酸而导致生物膜 分散 。, 。 3.2 D-氨基酸与葡萄球菌 葡萄球菌(Staphylococci)是临床 中最常见的革兰阳性球菌,其中金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球 菌(Staphylococcus epidermidis)为最常见的生物被膜菌,易粘 附在医学没备表面或宿主组织形成生物膜,导致生物膜相关感 染 ,如:表皮葡萄球菌常粘附于人工心瓣膜和各种导管等;金 黄色葡萄球菌则常直接侵犯宿主组织,在可粘附组织上引发生 物膜感染,如:伤口感染、骨髓炎、肺CF、脓毒性关节炎和心内 膜炎等ll 。生物膜一旦形成,则耐药性大大增加,若不及时处 理则可进一步侵犯血流形成败血症,最终危机病人生命l_2 。因 此,抑制葡萄球菌生物膜形成或及时分散已存在的生物膜至关 重要。 与枯草芽孢杆菌类似,金黄色葡萄球菌在静止期也能自发 产生一系列I)I氨基酸。这些I)_氨基酸对葡萄球菌形成的生物 膜同样有抑制或分散作用。在这些【)_氨基酸中,以D-Phe、IN 脯氨酸(D-Pro)和D-tyr的效果最明显,而其它【)I氨基酸的作用 很弱甚至没有作用。这些 氨基酸的浓度在500 mol/L时就 中国病原生物学杂志 2015年4月 第10卷第4期 Journal of Pathogen Biology April 2015,Vo1.10,No.4 能明显抑制金黄色葡萄球菌生物膜的形成,且相互之间有协同 作用,当这些【)I氨基酸等比例混合时,只需要10 t ̄mol/L即可 达到相同的抑制效果。此外,这些【)_氨基酸还能抑制不同材质 (如:聚苯乙烯、环氧树脂和玻璃表面等)上生物膜的形成[1 。 然而,如果要达到分散成熟生物膜效果,则需要更高浓度(10 mmol/1 )的 氨基酸。这些I)I氨基酸不仅能够在体外抑制和 分散葡萄球菌形成的生物膜,对大鼠体内骨植入物表面形成的 生物膜也有相同的作用[ 。然而,与这些I)I氨基酸相对应的 I 一型氨基酸均无抑制和分散生物膜的作用。此外,D一氨基酸的 分散作用并非因为杀灭生物膜中的细菌,因为抑制或分散剂量 的【)I氨基酸并不影响生物膜菌或浮游菌的增殖Ezg]。其发挥效 应的原理类似于枯草芽孢杆菌:一方面作用于金黄色葡萄球菌 生物膜的基质成分抑制金黄色葡萄球菌细胞壁中TasA的合 成,并且阻碍淀粉样蛋白在细胞壁表面的正常定位而发挥作 用;另一方面,D一氨基酸虽然不能阻止细菌的起始粘附,但可抑 制后期细胞的聚集而阻止生物膜形成 。 3.3 D-氨基酸与铜绿假单胞菌 铜绿假单胞菌为临床分离率 最高的革兰阴性杆菌,为常见的机会致病菌。常导致呼吸道和 伤口等部位的感染,铜绿假单胞菌容易形成生物膜,大大增加 了其耐药性,成为临床治疗的棘手问题。铜绿假单胞菌相关生 物膜主要见于肺CF、伤口慢性感染、导管相关尿路感染、慢性 鼻窦炎、慢性中耳炎以及隐形眼镜相关角膜炎等_3 。科学家发 现从枯草芽孢杆菌分离出的【)I氨基酸同样也能抑制铜绿假单 胞菌生物膜形成,也能分散铜绿假单胞菌成熟的生物 膜l】 。然而I)_氨基酸对革兰阴性菌生物膜的抑制或分散 作用的分子机制目前还未完全阐明D 。Brandenburg等 ,通 过测量生物膜相关生物学指标,如:生物膜总量、平均厚度及最 大生物膜厚度的变化来研究两种【)_氨基酸混合物即:D-Leu+ D-Met或D-try+D-tyr对用流动小室法构建的铜绿假单胞菌生 物膜分散作用时发现:与未用 氨基酸处理的对照组相比,【)_ 氨基酸混合物能有效分散大部分铜绿假单胞菌形成的生物膜, 生物膜总量有所减少、生物膜平均厚度减少了78 、生物膜最 大厚度减少了59 。 然而,与之前研究不同的是,研究者通过绿色荧光蛋白和 碘化丙啶对死/活细胞进行荧光染色后发现这些效应不单纯是 I)_氨基酸分散作用所导致的,D一氨基酸还能杀灭生物膜中71 的活细胞,而未用【)I氨基酸处理的对照组几乎无死细胞口 。 氨基酸对铜绿假单胞菌的杀菌作用,一方面可能是因为这些 r)I氨基酸在较高浓度时能作用于某些肽酶和蛋白酶,抑制细胞 壁的合成并能改变肽聚糖的代谢。另一方面,I)_氨基酸还能掺 人细胞壁重要成分肽聚糖中,直接导致结构上的损害[a4-3 5]。此 外,与Kolodkin—Oal等m 的发现不同,Brandenburg等 。 还发 现L-try也能抑制生物膜的形成并且有一定的分散效果,与【)_ try的作用效果相当,且两者联用时有协同作用。研究者发现, 与对照组相比,用10.0 mmol/L D-try处理铜绿假单胞菌生物 膜24 h后能抑制71 的生物膜,48h达78 。类似,10.O mmo|/L L—try处理24 h能抑制86 生物膜形成,48 h能抑制 81 生物膜形成。L try能增加PA的游动性,抑制细菌起始的 粘附,这可能是导致生物膜抑制的原因之一[3 。 3.4其他此外,D氨基酸与其他抗菌药物联用也有协同作 用。例如:【)I半胱氨酸(D-Cys)、D-或I 一天冬氨酸(D-/L—Asp)、 ・ 379 ・ r)I或L一谷氨酸(I)_ I,Glu)能显著提高乳链菌肽抗变形链球菌 活性 。 ];D-氨基酸能增强MRSA对克林霉素、利福平和万古霉 素的敏感性,能部分恢复多重耐药铜绿假单胞菌对黏菌素、环 丙沙星、亚胺培南、头孢他啶和他唑巴坦的敏感性_37 ;13-氨基酸 还能与3’,3’一二氨基二丙基胺norspermidine联用协同分散枯 草芽孢杆菌的生物膜 等等。 3 展望 I)_氨基酸因其很少会引起抗生素选择变异而引起的耐 药 ],且能有效分散生物膜使之成为浮游菌而恢复其部分耐药 性,以及I)I氨基酸对人体无毒等特点,有望成为控制生物膜感 染的有效措施。目前,有关I)_氨基酸治疗生物膜相关感染的研 究均相对较肤浅,且绝大部分局限于体外实验,能否阐明其作 用机制及投入到I临床应用还有待进一步研究。 【参考文献】 [1]伍勇,陈丽华.重视细菌生物被膜导致的细菌耐药及解决方案 [J].中华检验医学杂志,2014,37(10):725—7. 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